popgene
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1.32为最新版，感觉这个软件好老
根据官方文档使用提供的文件/* Test Data Set II: Diploid Data */ 进行测试。
结果文件内容是，
Single-Population Descriptive Statistics：
1.群体1的第1-x位点 遗传多样性信息（因为结果文件里是缩写，需要查找相应的含义），
- 群体1 x位点的等位基因频率
- Summary of Genic Variation Statistics for All Loci
- Summary of Heterozygosity Statistics for All Loci
The Ewens-Watterson Test for Neutrality：
Multi-populations Descriptive Statistics：
Overall Allele Frequency :
Overall Summary Statistics:
遇到的问题：
1.好像只能计算种群之间的遗传距离，不同个体之间的遗传距离是不是需要从文件的格式下手
- 可自选需要分析的内容，根据作软件提供的样本数据可计算相应一些内容，先了解大概流程。
Structure Harvester
将structure结果文件压缩，使用下面的网站进行一顿计算
Structure Harvester
使用自有数据出现数据，先使用网站自带结果数据可进行下一步分析。
最佳k值计算方法
-Blackwell Publishing, Ltd.Detecting the number of clusters of individuals using the software
STRUCTURE: a simulation study
Structure Harvester上的delta k 计算结果
一般选择混合模型
LOCPRIOR模型：利用取样位置作为先验信息来辅助聚类——用于结构信号比较弱的数据集
两个文件需要查看structure相关文件
indfile 内的内容是 某个体、所属取样群体、计算属于某个基因池的概率
popfile 内容是取样群体落入某基因池的概率，
clumpp
不明白这个软件是做什么用的。
distruct
使用Structure Harvester 网站提供的结果勉强做出结果
