在肿瘤研究领域一些特定类型的细胞他的作用不是由自身决定的,而是由周围的微环境决定的,比如CAF
过去 CAF 领域已经有很多分型:
myCAF、iCAF、apCAF、matrix CAF、vascular CAF、hypoxic CAF……
这些分类主要来自 scRNA-seq 或蛋白 marker,也就是说研究的是:CAF 自己表达什么?
但 CAF 最大的特点之一恰恰是高度依赖周围环境。一个 CAF 周围是癌细胞,还是macrophage,还是 T/B cell,很可能直接决定它的状态和功能。
scRNA-seq 最大的问题是把组织消化以后,空间关系丢失了。
CAF 是否存在一种跨癌种保守的“空间生态分类”?
换句话说,能否根据 CAF 所处的 cellular neighborhood,而不是单纯根据自身 marker,对 CAF 进行分类?
目前与CAF一样,有研究领域特征潜质的细胞类型
| 细胞类型 | 环境依赖程度 | 主要受到什么影响 | 最典型的结果 |
|---|---|---|---|
| 肿瘤相关巨噬细胞 TAM | 非常强 | 邻近癌细胞、CAF、血管、缺氧、代谢物、趋化因子 | 免疫抑制、炎症、组织修复、血管生成、抗原呈递等不同状态 |
| 肿瘤相关中性粒细胞 TAN | 非常强 | TGF-β、IFN、G/GM-CSF、缺氧、癌细胞分泌物 | 可出现促癌或抗癌功能 |
| T 细胞 | 非常强 | 抗原持续刺激、CAF、髓系细胞、TLS、代谢/缺氧 | effector、exhausted、Treg、stem-like、Tfh 等状态 |
| 肿瘤内皮细胞 TEC | 很强 | 缺氧、VEGF、血流、组织来源、免疫和基质信号 | angiogenic、免疫调节、高内皮样等状态 |
| 树突状细胞 DC | 很强 | 肿瘤因子、炎症、代谢环境、空间位置 | immunogenic ↔ tolerogenic、成熟/未成熟状态 |
| B 细胞/浆细胞 | 很强,尤其依赖 TLS | TLS 成熟度、Tfh、DC、CAF、抗原 | GC B cell、plasma cell、regulatory B cell 等 |
| 癌细胞 | 很强 | CAF、免疫、缺氧、机械力、治疗压力 | EMT、stemness、免疫逃逸、耐药、lineage plasticity |