MOVICS包导入数据步骤

library("MOVICS")
# load example data of breast cancer1.载入示例数据
load(system.file("extdata", "brca.tcga.RData", package = "MOVICS", mustWork = TRUE))
names(brca.tcga)
sapply(brca.tcga, dim)

可以看出，brca.tcga中有以下几个数据集

image.png

从sapply函数中可以看出几个数据集行可不同，但列相同。那我们看看行，列分别代表什么

mo.data$mRNA.expr[1:5,1:5]
mo.data$lncRNA.expr[1:5,1:5]
mo.data$meth.beta[1:5,1:5]
mo.data$mut.status[1:5,1:5]

image.png

image.png

可以看出行代表基因等，列代表样本。