如何将多个小分子文件合并为单个

开年第一篇:


(1)linux系统下直接输入使用cat命令

具体用法:

cat 小分子文件名 > 单个小分子的文件名

例:文件夹下小分子名称为

1.sdf 

2.sdf 

 3.sdf

指令为:

cat *.sdf > three-to-one.sdf

cat 1.sdf 2.sdf 3.sdf >  three-to-one.sdf


(2)使用openbabel,开源化学信息学软件,win下,linux皆可

网址为:http://openbabel.org/wiki/Main_Page

具体用法:obabel 输入文件名 -osdf -O 输出文件名

例:

1.mol

2.mol

3.mol

指令:obabel *.mol -osdf -O new.sdf

注:-osdf 此处sdf为输出文件的格式,如果你想要mol2,即转化为-omol2


元宵节快乐。

个人公众号:FindKey


最后编辑于
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
平台声明:文章内容(如有图片或视频亦包括在内)由作者上传并发布,文章内容仅代表作者本人观点,简书系信息发布平台,仅提供信息存储服务。

推荐阅读更多精彩内容