基于综合生物信息学分析的SERPINE1、PLAU和ACTA1作为头颈部鳞状细胞癌生物标志物的鉴定

Identification of SERPINE1, PLAU and ACTA1 as biomarkers of head and neck squamous cell carcinoma based on integrated bioinformatics analysis | SpringerLink (53yu.com)

背景

头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）是全球发病率最高的六大癌症。由于早期缺乏症状，HNSCC患者的5年生存率仍低于65%。因此，可以改善HNSCC检测的生物标志物应改善临床结果。

方法

基因表达谱（GSE6631，GSE58911）和癌症基因组图谱（TCGA）HNSCC数据用于综合生物信息学分析;然后对差异表达基因（DEGs）进行功能和途径富集分析，构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络。随后，对PPI网络进行模块分析，并对子网中枢纽基因进行总生存期（OS）分析。最后，使用免疫组织化学来验证所选标记物。

结果

共鉴定出52个上调和80个下调DEG，主要与ECM-受体相互作用和粘连信号通路有关。重要的是，从DEGs筛选了一组预后特征，包括SERPINE1，PLAU和ACTA1，这可以预测TCGA队列中HNSCC患者的OS。临床样本实验进一步验证了这3个特征基因在口腔上皮发育不良和HNSCC中异常表达，并与HNSCC患者的侵袭性相关。