tidyverse包简介

tidyverse包是对一些具有相同思想,且可以一同工作的R包的收集。
载入tidyverse包的时候提醒哪些包是一同载入的,哪些包是有冲突的。

> library(tidyverse)
── Attaching packages ─────────────────────────────────────── tidyverse 1.2.1 ──
✔ ggplot2 2.2.1     ✔ purrr   0.2.5
✔ tibble  1.4.2     ✔ dplyr   0.7.6
✔ tidyr   0.8.1     ✔ stringr 1.3.1
✔ readr   1.1.1     ✔ forcats 0.3.0
── Conflicts ────────────────────────────────────────── tidyverse_conflicts() ──
✖ dplyr::filter() masks stats::filter()
✖ dplyr::lag()    masks stats::lag()

这些包按照功能可以分为数据导入、数据整理、数据转换、可视化、建模、编程。

1. 数据导入

  • readr:read_csv(); read_tsv(); read_delim(); read_fwf(); read_table(); - read_log();
  • readxl:read_xls(); read_xlsx();
  • haven:打开SAS 、SPSS、Stata等外部数据

这里要提一下,read.table()是R自带的,而read_table()是readr包有的。

2. 数据整理

  • tibble: 对data.frame的改进,一种数据格式
  • tidyr:清洗数据 gather(); spread();

Tibble是数据框的一种形式,但是比数据框更整洁,结构更加紧凑,可以理解为tidy table之意。可以通过转置函数as_tibble()来将data.frame格式的数据转化为tibble格式的数据。tibble数据输出到console上只会显示前10行,和所有列,这和data.frame不同。

spread函数

分散函数是将变量中的值拆分成新的变量,这个过程概括为就是将为成「列」的值,进行拆分,并指定其他列作为「值」,组合成「键-值」对的形式

spread函数

#spread函数语法
spread(data, key= , value=, )
#以table2数据集为例子
table2 #查看数据集
table2 %>% 
  spread(key = 'type', value = 'count')

将type列的值拆分作为「键」,count列的值则作为每个键下的「值」,进而将变量值进行拆分。

gather函数

#gather函数语法
gather(data, set_colums, key= , value=, ...)

# 以tidyverse包中的table4a数据为例
table4a #查看数据集
table4a %>% 
  gather(`1999`, `2000`, 
  key = 'year', value = 'cases')

3. 数据转换

  • dplyr:处理数据 mutate();select(); filter(); summarise();arrange();
  • lubridate:处理时间数据
  • stringr:处理字符串类型
  • forcats:处理因子变量(factors)

dplyr包必须掌握的一些基础且常用的功能:

变量筛选函数 select
记录筛选函数 filter
排序函数 arrange
变形(计算)函数 mutate
汇总函数 summarize
分组函数 group_by
多步操作连接符 %>%
随机抽样函数 sample_n,sample_frac

4. 数据可视化

  • ggplot2

5. 编程

  • magrittr:管道运算符
  • purrr:通过提供一些完整连贯用于函数和向量的工具集,增强R的函数编程。

magrittr常见功能

5.1 %>% 从左向右顺序操作

x %>% f 等于 f(x)
x %>% f(y) 等于 f(x, y)
x %>% f %>% g %>% h 等于 h(g(f(x)))
x %>% f(y, .) 等于 f(y, x)
x %>% f(y, z = .) 等于 f(y, z = x)

5.2 %T>% 向左操作符

rnorm(200) %>%
matrix(ncol = 2) %T>%
plot %>% # plot的结果我们不需要,%T>%帮助我们把左边的结果传给plot后保留下来再传给colSums。
colSums
image

5.3 %$% 解释操作符

%% 的作用是把左侧数据的属性名传给右侧,让右侧的调用函数直接通过名字,就可以获取左侧的数据。比如,我们获得一个data.frame类型的数据集,通过使用 %%,在右侧的函数中可以直接使用列名操作数据。

> set.seed(1)
> data.frame(x=1:10,y=rnorm(10),z=letters[1:10]) %$% .[which(x>5),]
   x          y z
6   6 -0.8204684 f
7   7  0.4874291 g
8   8  0.7383247 h
9   9  0.5757814 i
10 10 -0.3053884 j

同时这不能被%>%所实现

5.4 %<>% 复合赋值操作符

%<>%复合赋值操作符, 功能与 %>% 基本是一样的,对了一项额外的操作,就是把结果写到左侧对象

> set.seed(1)
> x<-rnorm(100) %<>% abs %>% sort %>% head(10)
> x

注意 %<>% 必须要用在第一个管道的对象处,才能完成赋值的操作

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