了解前提
- 微卫星：整个基因组有超过 100000 个被叫作「微卫星」的短串联重复序列区域，复制过程中易于滑动出现错误，因此非常依赖于 MMR 系统修复。
- 错配修复MMR（mismatch repair）：系统成员包括MLH1，MSH2，MSH6 和 PMS2等蛋白。DNA 复制过程中偶尔会出现小 DNA 错配错误，可以被这些蛋白识别后剪切，并合成新链进行修复。 4 个蛋白出现异常时，引起 MMR 缺陷（deficient MMR, dMMR），不能发现和修改微卫星复制错误而造成弥漫的微卫星不稳定（microsatellite instability, MSI）。
定义
Microsatellite Instability（MSI），即微卫星不稳定性，是指DNA复制过程中，错配修复机制（DNA mismatch repair, MMR）失灵，致使重复片段增加或减少无法被机体修复，引起微卫星长度变化的现象。
以正常DNA为模板进行复制时，核心重复碱基少了，正常机体能够识别合成的错误DNA进行修正，而肿瘤组织则因为DNA修复蛋白出现障碍，无法修复。
MSI
在基因分布图上表现为在一个峰两侧的宽度增加【基因的长度增加、减少，导致峰宽度变宽】，如下图
基因分布图MSI
分类
在癌症患者中不一定全部出现MSI，根据MSI的发生情况可分为
（1）MSS：
Microsatellite Stability，微卫星稳定性。即微卫星不发生突变。
（2）MSI-L：
Low-frequency MSI，低频微卫星不稳定性，即患者微卫星突变检测出的频率低。＜40%的微卫星位点发生变化
（3）MSI-H：
High-frequency MSI，高频微卫星不稳定性，即患者微卫星突变检测出的频率高。≥40%的微卫星位点发生变化
评估指标
marker：
①经典指标
NCCN推荐
②商业开发的更为灵敏
第二组marker
①可进行荧光PCR 引物对多个微卫星多态位点进行扩增【BAT25，BAT26，D2S123, D5S346 和 D17S250 】，然后通过毛细管电泳对多态性扩增片段进行分离，通过荧光检测系统（如ABI 测序仪）确定扩增片断的长度，实现对微卫星多态位点的分型。PCR 是检测的金标准，能够更客观地评估功能性 dMMR 活性，但是对实验室条件要求高，价格相对昂贵。
②免疫组织化学法 (immunohistochemistry, IHC)，如MLH1、MSH2、MSH6 和 PMS2的免疫组化，如果 4 个蛋白中 ≥ 1 个不表达，肿瘤可能为 MSI-H。IHC 便宜易行，但是有可能漏掉一些其他 MMR 蛋白引起的异常，而且由于肿瘤的异质性，整个肿瘤的评分有可能不一致。
生物意义
虽然大部分微卫星位于非编码区，但是错置的突变会导致移码突变，引起肿瘤相关基因出现异常，进而诱导癌症发生。
- MSI存在是结直肠癌手术预后良好的标志！
- MSI-H的结直肠癌患者5-FU药物化疗基本无效
- BRAF(V600E)突变显著影响MSS患者预后、而MSI-H患者预后不受影响
4.MMR/MSI 还可以预测免疫治疗的疗效。MSI-H/dMMR 肿瘤突变多，具有广泛的免疫源性，因而对于 PD-1/PD-L1 抑制剂反应良好。其潜在原因可能是MSI患者的癌细胞变异更大，更易于免疫识别。
参考文章：
