2022-11-30 一些比较杂的问题解决方法

1.在Python上用scanpy分析单细胞的时候,做到sc.pp.calculate_qc_metrics(adata, qc_vars=['mt'], percent_top=None, log1p=False, inplace=True)这一步时报错:

ValueError: Length of values (1) does not match length of index with sc.pp.calculate_qc_metrics(adata)

原因是pandas版本>1.3,导致的不兼容
解决方法:把pandas卸载了,重新安装1.2.5版本
pip uninstall pandas
pip install pandas==1.2.5

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