Best of Cancer Cell 2024(二)| 空间多组学揭示黑色素瘤新辅助+免疫治疗机制

作为专注肿瘤研究领域的顶尖期刊,《Cancer Cell》致力于将癌症的复杂生物学与可行的治疗策略紧密联系起来,弥合发现与临床影响之间的差距,从而促进癌症研究与肿瘤学的发展。那么,在过去的一年中,各癌种研究取得了哪些突破性进展呢,在Best of Cancer Cell系列推文中,小编将详细为您分享。

研究疾病:黑色素瘤

样本类型:FFPE组织

样本分组:治疗前、治疗后(不同时间点);MPRs、non-MPRs

应用技术:DSP、10X Visium、Bulk RNA-seq、蛋白质谱、微生物组等

◎要点速览:

1. 新辅助治疗增强了主要病理缓解(MPR)患者中的CD8+ 肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)浸润及表现出CD303+ pDCs和CD45+细胞的共定位;

2. 新辅助治疗应答和耐药的转录组学和空间转录组学特征;3. 外周血对新辅助治疗反应的免疫和蛋白质组学相关性;

4. 粪便微生物组特征与对新辅助治疗的反应有关。

研究背景

肿瘤内注射TLR9激动剂(TLR9a)可刺激小鼠模型和人类的先天和适应性抗肿瘤免疫反应;TLR9a与免疫检查点抑制剂组合,在PD-1难治性转移性黑色素瘤患者中产生应答;然而TLR9a在癌症患者中的确切作用机制尚不清楚。

研究思路

研究结论

本研究报告了一项新辅助TLR9激动剂vidutolimod联合抗PD-1 Pembro治疗高危可切除黑色素瘤的单组研究,利用DSP技术、转录组及空间转录组、蛋白质谱、微生物组等技术探索了该种新辅助免疫治疗黑色素瘤的响应机制。该治疗在31例可评估的患者中观察到55%的MPR。免疫组化结果显示,MPR肿瘤的残留区域突出表现为存在色素噬黑细胞、三级淋巴结构(TLSs)和CD8+ T细胞浸润以及区域坏死。

GeoMx数字空间分析(DSP)结果显示,治疗后肿瘤在MPR患者中表现出CD303+ pDCs和CD45+细胞的共定位以及存在骨髓细胞和巨噬细胞的标记物和免疫激活浸润的现象。转录组和空间转录组特征揭示了B细胞活化增殖相关的cluster 4是新辅助治疗响应的特异细胞簇,新辅助反应与pDC密度增加、单核细胞/巨噬细胞活化和吞噬作用相关,强调了pDC和髓样细胞在新辅助治疗中介导效应的作用。

本研究还探究了不同时间点治疗后MPR和非MPR之间外周血中的免疫和蛋白组的差异,结果发现相较于新辅助抗PD-1治疗,新辅助vidu/nivo方案治疗导致不同的蛋白质组变化,MPR组巨噬细胞迁移(CD74)和程序性细胞死亡(CASP3)标志物明显增加。除了之前在抗PD-1治疗中所显示的结果外,vidutolimod还在CD4+ T细胞、pDCs和单核细胞中发挥累加性免疫调节作用,有助于病理反应。最后,该研究探索了肠道微生物组组成与新辅助vdu /nivo病理反应的关系,发现革兰氏阴性菌群与MPR之间存在显著相关性,并且与抗PD-1治疗的黑色素瘤患者相比,vidu/nivo患者与治疗反应相关的肠道微生物组组成几乎相反。

研究意义

本研究提供了新辅助瘤内注射增强抗PD-1治疗的证据,该方案可提高高危可切除黑色素瘤的病理反应率。研究发现,联合治疗刺激了广泛的抗肿瘤免疫反应,并与明显的基线髓系基因特征和肠道微生物组组成相关。这些发现对正在进行的针对多种癌症的vidu/anti-PD-1多中心临床试验具有指导意义。

原文链接:

https://www.cell.com/cancer-cell/abstract/S1535-6108(24)00395-7

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