GeneCard数据库

当你在研究一个基因时,你应该首先应该知道这个基因的研究的进展,如该基因是否是个与癌症相关基因,它在各种细胞系或者组织中的表达,它的产物能与哪些蛋白质相互作用,参与了哪些细胞通路,这样才能避免制造相同的轮子。你可以根据你想了解的相关信息查询相关文献或者相关数据库或者网站,这件你就有可能需要看很多文献或者网站。
下面给大家介绍一个可以轻而易举的获得该基因的全面的信息的网站——GeneCards。GeneCards(http://www.genecards.org/#),是一个全面的,综合的收集所以已知的或者预测人类基因。它整合跟基因相关的基因组、转录组、蛋白质组、临床等相关信息,收集整理了超过100个网站的数据。
下面我将简单给大家演示一些网站的作用。
1)进入GeneCard网站,你将看看如图1的主页,我们便可以在搜索框,如图1红色搜索框输入你的gene名称,或者你可以选择你输入的类型,见图2黄色方框。输入EGFR,点击search,弹出图3界面,可以看到以EGFR为关键词搜索,得到很多相关的结果,结果页面第一个便是我们想要的基因,见图3红色方框,点击EGFR,得到EGFR基因信息,图4。

图1.主页
图2.GeneCard网站搜索页面
图3.GeneCard网站结果页面
图4.EGFR基因信息1

在EGFR结果页面中你将看到很多EGFR的信息,下面我将简单给大家介绍该网站收录的信息。基因名称信息:该网站收录很多其他网站(HGNC,NCBI,uniprot…)的基因名见。而且你还可以点击对应名称,到相应网站。

GeneCard网站结果把其他网站(Entrez Gene,GeneCards,UniProtKB/Swiss-Prot…)EGFR的概要信息放在一起,供研究者查看。

GeneCard网站结果页面展示了EGFR在基因组的信息,该网站还收录的基因调控信息和表观信息。

图5.EGFR基因信息2

---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------I am a line !Thanks!--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------

©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 215,245评论 6 497
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 91,749评论 3 391
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 160,960评论 0 350
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 57,575评论 1 288
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 66,668评论 6 388
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 50,670评论 1 294
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 39,664评论 3 415
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 38,422评论 0 270
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 44,864评论 1 307
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 37,178评论 2 331
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 39,340评论 1 344
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 35,015评论 5 340
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 40,646评论 3 323
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 31,265评论 0 21
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 32,494评论 1 268
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 47,261评论 2 368
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 44,206评论 2 352

推荐阅读更多精彩内容