infercnv Error in `ScaleData()`: ! No layer matching pattern 'data' found. Please run NormalizeDa...

原因

  • 我的R运行环境里，用的是Seurat v5，出现这个问题主要是Infercnv与新的Seurat对象不兼容

解决

  • 在运行infercnv::run()之前，运行代码：
options("Seurat.object.assay.version" = "v3")
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