一个全世界知名的科学家,深爱着自己的家庭妻子儿女和朋友,大女儿安妮,聪明,单纯,固执,对一切充满好奇,在她出生伊始,达尔文,仔细观察认真记录一丁点的变化,艾玛曾戏称达尔文把女儿当成猿人类的试验标本……可一次海边的嬉戏,让安妮染上了风寒,达尔文最信任的水疗也没能挽回可爱的安妮……从此,深爱着的达尔文和艾玛产生了分歧,达尔文从科学的角度探求真相……艾玛从宗教的角度寻求慰籍……同时,两个人都不敢面对安妮的死,都在自己的内心强烈自责……
达尔文在强烈的悲伤自责甚至在自己坚信上帝不存在又艾玛的笃信上帝的矛盾痛苦中身体每况愈下,在回忆安妮,在与自我斗争中,几乎放弃自己的生命……
这时,好朋友胡克,强迫他治疗,告诉他“即便被绑在十字架上,也会有很多的朋友支持你,和你在一起……”水疗师也强迫他面对最真实的自己才能让自己真的痊愈……
达尔文回到家,勇敢的面对自己,也让艾玛勇敢的面对自己,当艾玛说“即便是知道一定经历这些苦难,也愿意重新嫁给你一次,我的爱”……他们和好如初了……
最终,达尔文经过二十多年的时间完成了二百五十多页的《物种起源》,重新获得了余下三个孩子的爱和信任,让害怕永生永世与亲爱的人分隔的艾玛成为了自己最坚固的队友……