最近开启了新篇章：分析空间转录组和单细胞数据。

头大。。。。。

这新技术一天一个样子。
想想这些个新技术有的时候也是蛮鸡肋。
追吧，不太适用于现在所关注的肿瘤类型。
不追吧，人家都在用，没那么几张图就显得很不高级。
总之就是一个 大写的无奈。
现在大部分空间转录组数据集中在脑组织和心脏组织，等等其他空间结构比较重要的组织。
而且，更加重要的一点是空间转录组的resolution很低。
一个spot一般包括5-10个细胞，所以spot注释就很粗糙。
虽然，现阶段有很多中方法给你注释，但就我试过的，结果不咋好。
不知道是不是我技术的问题（希望不是，哈哈哈。）

所以，现在很多空间转录组的数据需要和单细胞转录组一起分析。
用单细胞中鉴定的细胞类型去注释空间转录组中spot的类型。
下面这张图，就是现阶段有的用于两种数据联合分析的方法。

联合分析方法

这也是从别人那边copy过来的，想看具体介绍。
以下是连接：热点综述 | 单细胞+空间转录组的整合分析方法总结 - 知乎 (zhihu.com)