生信小组day4–Mr.Possibility

R语言基础

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准备工作

  • 安装R和Rstudio到自己电脑
  • 安装到服务器,再通过网页访问8787端口个人推荐这样,因为可以使用沙拉查词辅助阅读帮助文档

检查电脑用户名是否为中文

  • 打开文件管理器,进入桌面某文件夹
  • 点击导航栏看地址
  • 如果是中文:参考生信星球

下载安装R和Rstudio

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一、认识R和Rstudio

来自生信星球

初次上手

plot(rnorm(50))

  • plot #图表
  • rnorm(50) #rnorm()函数产生一系列的随机数,随机数个数(在这里为50),均值和标准差都可以设定。

runif(5,10,50) #10到50的5个随机数

  • 5 #多少个数
  • 10 #数值范围最小值
  • 50 #数值范围最大值

boxplot(iris$Sepal.Length~iris$Species,col = c("lightblue","lightyellow","lightpink"))

  • boxplot #箱线图
  • iris #是一个R语言自带的数据框,用作示例
  • ~ #y轴对应x轴,在中间作连接作用的符号
  • col # color的缩写,代表颜色
  • c # 颜色

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设置R 的字体大小

Tools > Global Options > Apperences >选一个合适的字号>Apply

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R语言基本操作

1、用Rproject管理工作目录

  • 工作目录是什么?
  • 默认的读取和存储的位置

设置工作目录 setwd()
查看当前工作目录 getwd()

由于默认只有一个工作目录,如果搞多个项目,就会混在一起分不清

具体操作

  • 点击edit下面的立体方格新建一个project
  • 弹窗口会问你新建文件夹还是使用已经存在的文件夹
  • 中间需要填的directory name就是 你新建的project的name,两者同名。
  • 小技巧找到这个后缀为Rproj的文件,点击即可打开Rstudio

生信星球-用Rproj管理工作目录

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显示文件列表

dir() #相当于Linux里的ls

加减乘除

+
-
*
/
^ #次方
sqrt #开平方
abs #绝对值
log2() #紧跟的是底,括号里是求的数
log10()

赋值

->赋值符号 ,像个箭头,指向哪里就赋值给谁

删除变量

rm() #删除想要删除的变量

rm(list = ls ()) #清空所有变量

如果括号打成了全角括号会报错:

ls()
## Error: unexpected input in "ls? 

列出历史命令

history()

  • 双击在历史记录中的命令自动复制到控制台中

清空控制台

ctrl+l

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