前言
NR和NT数据库是做序列比对经常用到的数据库，小编接下来带你在本地集群上搭建这两个数据库
下载
下载链接： Index of /blast/db/FASTA
这两个数据库一直在不断地更新，数据也越来越大，截止2020-10-21，这两数据库压缩包一个82G，一个81G，想要通过网页下载比较困难，所以推荐使用下载工具aspera，使用教程可参考小编的另一个博客 NCBI数据下载工具：aspera的安装与使用 - 简书
使用以下命令下载：
cd /database/NR
ascp -i ~/asperaweb_id_dsa.openssh -QTr -l500m anonftp@ftp.ncbi.nlm.nih.gov:/blast/db/FASTA/nr.gz ./ #NR
cd /database/NT
ascp -i ~/asperaweb_id_dsa.openssh -QTr -l500m anonftp@ftp.ncbi.nlm.nih.gov:/blast/db/FASTA/nt.gz ./ #NT
安装使用：
这两个数据库下载下来后进行解压，解压完后建立blast的索引即可进行使用，在建立索引之前需要将blast软件bin文件添加到环境变量~/.bashrc中
gunzip -c nr.gz >nr.fa #解压
makeblastdb -in nr.fa -dbtype prot #makeblastdb 已添加环境变量
gunzip -c nt.gz >nt.fa #解压
makeblastdb -in nt.fa -dbtype nucl #nt为核酸序列，-dbtype 为nucl
此时该数据库可以直接使用，以NR数据库进行blastp为例
blastp -num_threads 8 -max_target_seqs 1 -evalue 1e-4 -outfmt '6 qseqid qlen qstart qend sseqid slen sstart send pident ppos qcovs bitscore evalue' -db /database/NR/nr.fa.00 -query test.fa -out test.fa.blast
数据库官方参考：https://www.biostars.org/p/235632/
