该数据库由德国科隆大学维护,是酶学专业综合性数据库,用于查询和比较不同生物体中酶的详细特性。
这些酶根据 Enzyme Commission 酶列表进行分类。
BRENDA 酶数据库(https://www.brenda-enzymes.org/)提供了酶的全面注释信息,包括激活化合物、氨基酸序列、应用、CAS 登记号、克隆、结晶、疾病与诊断、表达、通用信息、总体稳定性、IC50 值、抑制剂、催化效率 kcat/KM、抑制常数 Ki、米氏常数 KM、亚细胞定位、金属与离子辅因子、分子量、天然底物及产物、有机溶剂稳定性、来源物种、代谢途径、PDB ID、最适 pH、pH 范围、pH 稳定性、等电点 pI、翻译后修饰、蛋白质变体、纯化、催化反应、反应类型、参考文献、复性、来源组织、比活力、储存稳定性、底物与产物、亚基、别名、系统命名、最适温度、温度范围、温度稳定性及转换数 kcat 等酶学、理化、结构、功能与实验相关数据。
研究者可以通过EC编号、酶名称、底物或生物来源等多种方式检索酶的相关信息,BRENDA是生物化学、分子生物学、生物工程和药物开发等领域研究人员的不可或缺的工具。
酶分类层级
https://www.brenda-enzymes.org/ecexplorer2.php?browser=1

1 Oxidoreductases 氧化还原酶
催化电子转移反应(如脱氢、氧化),两分子间发生氧化还原作用,主要存在于细胞中,如乳酸脱氢酶、琥珀酸脱氢酶、细胞色素氧化酶等。
2 Transferases 转移酶
催化功能基团转移(如甲基、磷酸基),甲基转移酶、氨基转移酶、磷酸化酶等
3 Hydrolases 水解酶
催化水解反应(如肽键、糖苷键的断裂),如淀粉酶、蛋白酶、核酸酶、脂肪酶等,反应式为: A-B + H2O → A-H + B-OH
4 Lyases 裂合酶
催化C-C、C-O、C-N、C-S、P-O等化学键断裂(生成双键或环),只需要1个底物,或者在催化逆向反应时需要2个底物,如醛缩酶、水化酶、脱羧酶等,反应式为: A-B → A + B
5 Isomerases 异构酶
催化同分异构体之间的相互转化(如顺反异构、旋光异构),包括消旋酶、差向酶、顺反异构酶、变位酶以及分子内氧化-还原、分子内消去-加成反应等6个亚类
6 Ligases 连接酶
催化两个分子连接成一个分子或把一个分子的首尾相连接的酶,可形成C-C、C-N键等,(需ATP供能),例如DNA连接、肽链合成
7 Translocases 易位酶
催化离子或分子跨膜转运或在细胞膜内易位反应,如线粒体蛋白质转运ATP酶、ABC-型硫酸转运体、抗坏血酸铁还原酶等。
扩展页
结果查询页的【External Links】可以连接到相关数据库,以查看酶的氨基酸序列、核苷酸序列、三维结构等,具体见下图,例如NCBI的Pubmed数据库提供该酶的相关文献、Protein数据库提供相关氨基酸序列、Nucleotide数据库提供核苷酸序列、Structure数据库提供酶的3 or 4级结构。
