015 | 课题设计-如何从生信角度布局一篇5分的SCI

下面给大家展现的是4篇2019年的5分生信文章。这4篇文章都是纯生信分析的文章并且在2019年还能登顶5分杂志。4篇文章每个都有自己的创新角度,我们一个一个来分析。

01-m6A RNA methylation regulators contribute to malignant progression and have clinical prognostic impact in gliomas.

第一篇的创新在于立意创新。m6A甲基化是目前比较热门的研究领域之一,是mRNA最常见的转录后修饰之一。m6A甲基化由甲基化转移酶,去甲基化酶和甲基化阅读蛋白共同参与,重要的是这种修饰是可逆的,作者抓住这个核心思想,创新利意,不是去对甲基化测序分析,而是对甲基化修饰酶的变化进行分子分型,聚类结合重要突变信息,预后signature建立等方面进行多角度的深入阐述,并且对多套数据集进行验证,这也就是从不同维度确证了这个研究结果的科学性及可靠性,所以该文章能够在2019年进入5分杂志,另外文章的作图也是比较漂亮的。

这个分析角度我们可以对其他肿瘤进行类似分析,但是也必须加入其它肿瘤的特征突变,也可以结合一些高级算法比如甲基化免疫,如果创新点够用,还是可以登入5分的,但是图也是要漂亮,结论要有意义。

02-A Prognostic Signature for Lower Grade Gliomas Based on Expression of Long Non-Coding RNAs.

第二篇是我非常喜欢的一篇文章,文章整体思路非常简单清晰,创新在于进行了分层分析,我觉得这篇文章重点是图的可视化清晰易懂,并且写作也是非常棒的,体现了科技文章的可读性,科学性,并且结论也是有很大的参考价值。

03-Transciptome analyses identify a metabolic gene signature indicative of dedifferentiation of papillary thyroid cancer.

第三篇创新点有2个,一个是选择了代谢基因集,这样文章不是从全转录组角度出发,而是focus在代谢的分析上,第二个创新是根本,也是决定了文章能上5分的核心创新,就是该文章不是关注预后的signature的筛选,而是找到了一个和甲状腺癌分化有关的signature,这个创新非常值得我们借鉴。

04-Prognostic and predictive value of an autophagy-related signature for early relapse in stages I-III colon cancer.

第四篇文章是对人群进行了筛选,另外是focus在自噬基因对预后的影响,这个研究思路是目前比较普遍的,自噬基因在很多生物学过程起了关键作用,更重要的是,这个分析结果可以很好的和实验相衔接,如果在生物信息分析基础上,能做一些实验验证,恭喜你,你的文章不只5分。

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