常用绘图 分析软件

1、韦恩图 Venn Draw Venn Diagram (ugent.be)

2、STRING网站(STRING: functional protein association networks (string-db.org))-PPI互作网络。但一般不用STRING网站做的图,用STRING网站下载的tsv文件加载到cytoscope网站做分析.

3、cytoscope软件-PPI作图及分析。可以设置不同的颜色、形状、字体大小等。APPs-MCODE,可以找出互作网络中主要的Cluster。CytoHubba可以筛选出自定义数目的Hub基因。

4、DAVID网站-GO和KEGG分析,只能得到数据信息,无法作图

5、GEPIA网站-基因表达量和预后分析,但是预后分析一般用Kaplan-Meier Plotter。

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