2021-06-23 剪接因子数据集

        剪接对于基因表达起着极其重要的作用，一方面通过调控可变剪接，可以拓展转录组和翻译组；另一方面异常的剪接与肿瘤等人类重大疾病密切相关。基于临床大数据的剪接异常分析对于探索疾病发病机制是一个重要的研究方向。原本今天是要分享一个比较全面的剪接因子数据库，检索发现有SpliceFac，SFmap和SpliceAid-F等，但这些数据库发表年限较长，无法满足更加全面的剪接因子分析。不过，在阅读文献的过程中发现两篇剪接因子相关研究论文，其中均收集整理了最新的剪接因子相关信息。文献信息如下：

（1）Zhang, D. et al. Intron retention is a hallmark and spliceosome represents a therapeutic vulnerability in aggressive prostate cancer. Nat Commun 11, 2089 (2020).

（2）Sebestyen, E. et al. Large-scale analysis of genome and transcriptome alterations in multiple tumors unveils novel cancer-relevant splicing networks. Genome Res 26, 732-744 (2016).