windows安装ENMTools

• 安装好R 3.5 （64位） 和Rstudio （建议把32位的R同时勾上，一起装上,方便后面切换）

• 安装JDK（最好不要用JRE），安装和R版本相同的java（即64位的R，就安装64位的jdk，最好32和64位同时安装，下载地址

• 设置java的环境变量，参考这个帖子

  • 添加 jvm.dll to your PATH (参考这个和这个)
    • 打开windows环境变量：系统属性-高级系统设置-环境变量-Path-编辑（参考这个)
    • 去掉所有和java相关的变量(用户变量和系统变量都删除）
    • 添加到用户变量的PATH：%JAVA_HOME%\jre\bin\server;
  • 验证：
    • 在windows的CMD里面输入java，显示“'java' 不是内部或外部命令，也不是可运行的程序 或批处理文件。”

• 下载ecospat包

• 安装代码：

install.packages("rJava") # reinstall if you switch from x64 to x32 R version
library(rJava)
install.packages("devtools") 
library(devtools) 
# install the x64 and x32 version of JDK first, rather than JRE
Sys.setenv(JAVA_HOME="")
Sys.setenv(JAVA_HOME="C:\\Program Files\\Java\\jdk1.8.0_171\\")
# Sys.setenv(JAVA_HOME="C:\\Program Files (x86)\\Java\\jdk1.8.0_171\\") # for 32-bit R version, if the 64-bit is not working


install_github("danlwarren/ENMTools") # 如果出错“Error : object 'descendants' is not exported by 'namespace:phyloclim'”，用develop brach，即：
install_github("danlwarren/ENMTools",ref="develop") 
#提示错误，缺少ecospat包
install.packages(c('ade4', 'adehabitatHR', 'adehabitatMA', 
                   'biomod2', 'ecodist', 'maptools', 'rms', 'MigClim', 'gtools', 
                   'PresenceAbsence', 'classInt')) 
install.packages("C:/Users/18213/Downloads/ecospat_2.2.0.tar.gz", 
                 repos = NULL, type = "source")  # 安装下载的ecospat包, 路径换成你自己的
install_github("danlwarren/ENMTools",ref="develop") 

• 提示：如果下载ENMTools或者install.packages出错/没反应，可能需要翻墙

mac安装ENMTools

• 安装好R 3.4（不要升级到3.5）
• 安装代码：

install.packages("devtools") 
library(devtools) 
install_github("danlwarren/ENMTools") 
library(ENMTools)

• 如果因为java出错，更新java后设置好路径（参考这个帖子)

sudo ln -f -s $(/usr/libexec/java_home)/jre/lib/server/libjvm.dylib /usr/local/lib