Error in array(col.rgb[, i], dim(node.rgb)[3:1]) : negative length vectors are not allowed

使用pathview时遇到一个error，初始代码如下：

pathview(gene.data  = df_gene_KO$KEGG_ko,
                                     pathway.id = mapID,
                                     species = "ko",
                                     limit = list(gene=1, cpd=1),
                                     out.suffix = "suffix")

部分pathway可以正常生成，如ko00970

ko00970.A9_12_up.png

但是部分pathway无法生成，报错，如ko01230
ko01230.png

仔细对比发现，这两幅图的区别在于：
ko00970图中基因Kxxxxx是矩形方框，所以可以添加颜色；ko01230中基因Kxxxxx是线条，无法添加颜色

解决办法：
不要将颜色添加在同一图层，修改参数same.layer = T，代码如下：

pathview(gene.data  = df_gene_KO$KEGG_ko,
                                     pathway.id = mapID,
                                     species = "ko",
                                     limit = list(gene=1, cpd=1),
                                     out.suffix = "suffix",
                                      same.layer = T)

生成图形：


ko01230.suffix.png
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