Day-3 lzyazcr

今天的的任务是下载软件~

确定系统位数

unmae -a

打开服务器目录

cd  -/new

下载成功

wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

sh=Windows的exe

安装程序

bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh 

激活软件

source ~/.bashrc

添加镜像

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes

教程实在太详细了~

软件使用

查看软件列表

conda list###查看软件列表

搜索软件

conda search fastqc

安装（不加-Y安装中需要自己输入一些指令）

conda install fastqc -y

卸载

conda remove fastqc

——————

conda环境

查看当前conda环境

conda info --envs

建立新环境

conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic 

环境的激活~~

conda activate rna-seq