学习内容--R语言数据结构

数据类型（重点掌握向量、数据框）

向量（vector）

矩阵（Matrix）

数组（Array）

数据框（Data frame）

List

1. 向量

元素：数字或者字符串

标量：一个元素组成的变量

向量：多个元素组成的变量

来自生信星球

给变量赋值（可以是字符，也可以是数据框）

从向量中提取元素

根据元素的位置

根据值

2. 数据框

新建doudou.txt，输入以下

image.png

用命令X<-read.csv('doudou.txt')即可获得示例数据框

注:将示例数据一定要放在你的工作目录下，不然会报错，会出现找不到（X not found ）

（1）读取本地数据及对变量赋值

读取：read.table(file = "huahua.txt", sep = "\t", header = T)

注：“huahua.txt”，空格seq…… ，不然会报错

论这个空格的重要性（血淋淋的现实）

"sep"间隔符，"header"首行如果不是空的即首行做表头

赋值：a<-read.table(file = "huahua.txt", sep = "\t", header = T)

（2）设置行名和列名

colnames(x)—查看列名

rownames(x)—查看行名,默认值的行名就是行号，1/2/3/4...

x<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = " ",header =T,row.names=1)—最后row.names的意思是修改第一列为行名

（3）数据框的导出

write.table(x,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)—分隔符改为逗号，字符串不加双引号（默认格式带由双引号）,变量x数据框导出为yu.txt文件

（4）变量的保存与重新加载

save.image(file="bioinfoplanet.RData")—保存当前所有变量

save(X,file="test.RData")—保存其中一个变量

load("test.RData")—再次使用RData时的加载命令

（5）提取元素

• X[x,y]#第x行第y列
• X[x,]#第x行
• X[,y]#第y列
• X[y] #也是第y列
• X[a:b]#第a列到第b列
• X[c(a,b)]#第a列和第b列
• X$列名#也可以提取列（优秀写法，而且这个命令还优秀到不用写括号的地步，并且支持Tab自动补全哦，不过只能提取一列）
  引自：生信星球

（6）直接使用数据框中的变量

输入 a <-data.frame(case=paste("S",1:50),values=runif(50))

再输入 plot(a)

更高效的方法

方法1：attach

输入attach(a)

再输入plot(case,values)

做完后将a删除出搜索环境 detach（a）

局限性：两个以上数据框的列名有冲突时，同时attach会报错。

方法2：with

with就是把所有操作都限制在数据框上

with(a,{
plot(case,values)
x<<-summary(values) #求和并赋值给x,<<的意思是作为全局变量，也就是出了大括号仍有效。
})
x #运行完后打印x
引自：生信星球

最后附一张思维导图

R语言数据结构.png