学习内容--R语言数据结构
数据类型(重点掌握向量、数据框)
向量(vector)
矩阵(Matrix)
数组(Array)
数据框(Data frame)
List
1. 向量
元素:数字或者字符串
标量:一个元素组成的变量
向量:多个元素组成的变量
给变量赋值(可以是字符,也可以是数据框)
从向量中提取元素
根据元素的位置
根据值
2. 数据框
新建doudou.txt,输入以下
用命令X<-read.csv('doudou.txt')
即可获得示例数据框
注:将示例数据一定要放在你的工作目录下,不然会报错,会出现找不到(X not found )
(1)读取本地数据及对变量赋值
读取:read.table(file = "huahua.txt", sep = "\t", header = T)
注:“huahua.txt”,空格seq…… ,不然会报错
论这个空格的重要性(血淋淋的现实)
"sep"间隔符,"header"首行如果不是空的即首行做表头
赋值:a<-read.table(file = "huahua.txt", sep = "\t", header = T)
(2)设置行名和列名
colnames(x)
—查看列名
rownames(x)
—查看行名,默认值的行名就是行号,1/2/3/4...
x<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = " ",header =T,row.names=1)
—最后row.names的意思是修改第一列为行名
(3)数据框的导出
write.table(x,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)
—分隔符改为逗号,字符串不加双引号(默认格式带由双引号),变量x数据框导出为yu.txt文件
(4)变量的保存与重新加载
save.image(file="bioinfoplanet.RData")
—保存当前所有变量
save(X,file="test.RData")
—保存其中一个变量
load("test.RData")
—再次使用RData时的加载命令
(5)提取元素
- X[x,y]#第x行第y列
- X[x,]#第x行
- X[,y]#第y列
- X[y] #也是第y列
- X[a:b]#第a列到第b列
- X[c(a,b)]#第a列和第b列
- X$列名#也可以提取列(优秀写法,而且这个命令还优秀到不用写括号的地步,并且支持Tab自动补全哦,不过只能提取一列)
引自:生信星球
(6)直接使用数据框中的变量
输入 a <-data.frame(case=paste("S",1:50),values=runif(50))
再输入 plot(a)
更高效的方法
方法1:attach
输入attach(a)
再输入plot(case,values)
做完后将a删除出搜索环境 detach(a)
局限性:两个以上数据框的列名有冲突时,同时attach会报错。
方法2:with
with就是把所有操作都限制在数据框上
with(a,{
plot(case,values)
x<<-summary(values) #求和并赋值给x,<<的意思是作为全局变量,也就是出了大括号仍有效。
})
x #运行完后打印x
引自:生信星球