提到非编码RNA,大家最熟悉的就是miRNA, miRNA靶基因研究,miRNA-lncRNA研究等等。小编最近发现了一个miRNA的新研究:A-to-I edited miRNA。虽然它不是刚出现,但我想还是有很多人跟我一样初次遇见它
A-to-I是adenosine-to-inosine (腺苷-肌苷)的缩写。A-to-I 是广泛存在于人类中的一种RNA编辑方式,其机制是腺苷脱氨酶(ADARs)结合RNA分子的双链区域,将腺苷脱氨成肌苷。肌苷在细胞内会被识别为鸟苷,导致转录本中的非同义密码子变化以及产生选择性剪接。这种方式发生于转录后水平,不影响DNA序列。RNA-Seq的出现(与基因组比对)使得大量RNA编辑位点被识别,包括A-to-I编辑位点。目前,广泛使用的A-to-I编辑位点数据库是RNA编辑数据库(DARNED,http://darned.ucc.ie)。
言归正传,我们回到A-to-I edited miRNA。发生在miRNA序列上的A-to-I editing 会影响miRNA的靶向性并破坏其成熟,从而影响其功能发挥,包括其在癌组织细胞中的表达和功能。下面以miR-379-5p为例,介绍A-to-I edited miRNA在癌症中的功能改变。在癌症中存在着wild-type miR-379-5p和A-to-I edited miR-379-5p。
A-to-I edited miR-379-5p在结肠癌,头颈癌,肺癌等7种癌组织中的表达水平均低于正常组织。
而生存分析表明高水平A-to-I edited miR-379-5p能够延长肺癌和肾癌患者的无病生存期。
A-to-I editing同样引起了miR-379-5p靶基因的改变,wild-type miR-379-5p的靶基因是PTK2, 而A-to-I edited miR-379-5p则靶作用于CD97。
功能分析表明A-to-I edited miR-379-5p可通过靶作用于CD97介导癌细胞凋亡,从而发挥抑癌作用。
看完我的介绍,大家是不是都对A-to-I edited miRNA产生了浓厚的兴趣呢?
参考文献: