生信文献速递|WGCNA发文so easy
作者:白介素2
文章全篇应用生物信息分析,发表文章在 Bioscience Reports****杂志上,不过看起来文章实在有些匆促,不小心发现自己连自己的单位都写错了 Lanzphou University???,最近生信人的小编说: 灌水也需认真啊 。
摘要
这种文献看起来很快,关键词 GEO****数据集, WGCNA****分析,然后功能富集分析找 Hub gene一套操作下来说自己找到了重要的基因,然后后面不用看,就讨论基因的重要性,实在不行就验证一下。
看图说话
样本聚类热图展示
模块性状相关性热图展示
Hub gene生存分析
TCGA数据库验证表达,再加一个ROC曲线,CCLE数据库分析基因表达。
全文就到此结束了,思路非常简单;笔者想说的是,不要觉得这些分析结果看起来很简单,我说起来也很简单;其实要完成整篇文章的数据分析,图表准备,论文撰写,投稿等过程其实非常繁琐、复杂;需要耗费作者很多心血,在这样的过程中作者会得到一个完整的训练,从这一点上来讲,我尊重每一份努力和付出。
做这样的工作,其实我们都是被拘去做的;我只是希望,如果可能的话,我们尽可能的学习、思考、进步;不顾一切的灌水我不能赞同。
附上文献链接:Co-expression of key gene modules and pathways of human breast cancer cell lines
今天的内容就到这里,我是老朋友白介素2,下期再见。