今天开始了第三天的学习，今天的主要内容是linux下conda的安装。
以下步骤引用均自"生信星球"教程
1.下载miniconda的安装文件
1.1打开下载文件的网页，复制下载链接
下载连接
1.2输入指令wget (网址)
wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
1.3bash xxxx.sh运行安装文件
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
1.4激活软件
source ~/.bashrc
1.5 设置镜像
2.使用conda
2.1 查看软件列表
conda list
2.2 搜索软件
conda search fastqc
2.3安装软件
conda install fastqc -y
2.4(卸载软件)
conda remove fastqc -y
3.conda 环境
3.1 查看conda当前环境
conda info --envs
3.2 创建一个新环境
conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y
3.3 激活环境
conda activate rna-seq
4.安装体会
- 文件格式
在Linux下安装文件的后缀是.sh,在今天一开始的时候，不小心复制错了链接，下载成了.exe。结果bash的时候就出现了错误"cannot execute binary file" - 对环境的初步理解
对于不同的软件，需要不同的环境支持，在今天我按照教程尝试了配置了一个环境，对环境这个概念有了更深的理解。
以上就是今天对Linux的学习，最后感谢生信星球的指导！
