这是我在简书上写的第一篇文字，在这之前我已经使用简书许久了，一直在简书上获取解答，经常隔段时间就搜索同一个问题，主要是我又忘了怎么当初是怎么做的。于是，这一次，我想也把自己的一些东西记录下来，算是一种日记，如果刚好又解决了他人的问题，那便是最好的收获了。
这次从JAVA开始。
我之前做分析基因家族，主要用的是TBtools工具，结合hmmr，做出来的基因数量有点超出一般范围，主要是我没有舍去一些结构域稍微有点不符合要求的基因。尤其在近期重新阅读了一些文献后，我对之前做的基因家族分析结果越来越没有信心，就是想重新做一遍。而这之前，我们课题组的一位老师分享了她用脚本分析了她的基因家族，我知道有这种方法，并一直对此充满了好奇和兴趣，但是一直疲于行动，正好借这次机会，学习一下。
这种方法首先就是要安装Ubuntu系统，由于我的电脑已经分过一次盘了，这次实在是没有足够的空间来分盘，于是我对电脑进行了初始化（没错，我真的初始化了，这是我第二次对电脑初始化，跟上次相比，没有那么害怕了）。初始化之后，虽然D盘的软件都没有清除掉，但是由于没有JAVA，很多软件都运行不起来。
安装JAVA曾经是一件几近让我崩溃的事情，有了以前的经验，这一次，我似乎更平静，也顺畅了许多。
【好的，开始安装啦】
1、首先，要选择合适的JAVA版本。上一次我应该安装了至少五六次都不得行，最后是安装的这个版本的JAVA才成功。我要把它永远保存起来。
JAVA安装包
链接：https://pan.baidu.com/s/1T2HiHUO7BQQCzfqTkcRsRg
提取码：f0cf
2、安装。右键单击，按照提示安装下去，遇到选择安装目录和安装位置的地方注意一下，选择合适的位置就行。
3、配置环境变量。
然后进入你安装好的Java的位置的界面，大概到下面这个位置，复制上面的路径。
搜索“编辑系统环境变量”，进入下面这个界面。环境变量→系统变量中的“新建(W)…”。
按照下面图片新建一个系统变量。
4、配置path。
选择系统变量下的path，选择“编辑”，点击“新建”，输入“%JAVAA_HOME%\bin”
5、设置class_path。
在系统变量中选择“新建(W)…”，按照下图配置class_path。这个“.”表示当前路径，以后就能在任何路径下运行Java了。
6、测试是否安装成功。
Win+R。
输入“cmd”。
输入“java -version”，如果出现下面界面，显示了Java的版本，就说明安装成功了。
还可以继续输入“java”，出现一堆Java的指令。
