画ALL表达量的箱线图

BiocManager::install("ALL")  #下载ALL数据集
library('ALL')  #加载包
data('ALL')

看一下表达量数据:


image.png

画图:

exprSet=ALL@assayData[["exprs"]]
boxplot(exprSet)
image.png
  • 很明显,由于样本名是横排放置且样本比较多,所以样本名没有全部显示出来,需要我们进一步进行调整。
boxplot(exprSet,las=2)

得到标签垂直的图片,由于有128样本,竖放也很拥挤,所以可以看到分行排放了。


image.png

看一下放大的图片


image.png
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