由于酵素对人体疾病有良好的调理作用，因此有些人会认为酵素是一类用于治疗疾病的药物，甚至到医院要求医生用酵素来治疗疾病。其实这是一个误区，是混淆了治疗与调理的概念。为了说明这个问题，我们可以先了解一下酵素与药物有哪些不同。
首先来看药物，它一般都是针对病因或者症状发挥治疗作用，主要是依靠药物本身的特性来发挥治疗作用，效果一般比较快；在使用量上一般有严格的规定，量少则达不到治疗作用，过量则有可能对人体产生危害；很多药物一旦起效则可以一时性迅速改善病情，但停用则可能引起病情复发甚至反跳；大部分的药物一般不能长期使用，比如抗生素长期使用很可能引起耐药性；大多数药物都有其特定的适应症，必须符合才能做到使用有效；不同药物混合使用时要充分考虑到药物之间的相互作用，如果使用不当则可能对人体产生危害；很多药物在治疗疾病的同时也会产生对人体不理的毒性，甚至有严重的副作用。
再来分析一下酵素的特点，它对人体的调理作用通常是整体性的，在人体生理的多个缓解发挥租用，只是可能以某一方面的作用为明显或突出；酵素发挥作用的效果一般来得比较慢，需要一段时间的使用才能逐渐发现明显的效果；它对于使用量没有严格的限制，主要一句人体使用后的反应来确定一个合适的用量；一般主张长期使用酵素来对人体进行整体性的调养，并且一时的停用也不会导致原有亚健康状态的反复或反弹；酵素对于调理的适应症要求并不十分严格，这与它是从对缓解入手进行调理的特性有关；酵素的使用一般没有副作用，多种的酵素的联合使用一般也不用考虑相互间发生不良反应，因此使用比较安全。
通过以上的比较，我们可以看出酵素与药物在特性上有很大的不同，但二者的合理联合使用则可以使得药物更好地发挥人体疾病的治疗作用，而酵素对人体良好的调理作用又可以使得药物的用量和使用时间缩短，二者可谓相得益彰。
