今天跟大家分享一篇2022年4月发表在Frontiers in Genetics (2020 IF=4.6)上的一篇文章，题目为“A novel CRISPR/Cas9 screening potential index for prognostic and immunological prediction in low-grade glioma”。
摘要：
胶质瘤是中枢神经系统疾病中死亡率最高的一种恶性肿瘤。作者基于CRISPR/Cas9文库，采用CERES算法筛选出低级别胶质瘤（LGG）的致死基因，利用ssGSEA来创建一个新的CRISPR/Cas9筛选潜力指数（CCSPI）来预测低级别胶质瘤（LGG）的临床结果和生物学特征。文章将患者分层为低和高CCSPI组。与低CCSPI个体相比，高CCSPI患者与训练和验证集的预后较差有关（P < 0.0001），且免疫分数较高。CCSPI系统具有良好的性能，1年、3年和5年的AUC分别为0.816、0.779、0.724，nomogram模型的C-指数达到0.743（95%CI=0.725-0.760）。免疫浸润细胞和免疫检查点如PD-1/PD-L1和POLD3与CCSPI呈正相关。综上所述，CCSPI对LGG有预后价值，该模型将加深我们对不同LGG亚型的中枢神经系统和免疫系统之间相互作用的认知。
DOI: 10.3389/fgene.2022.839884
第一作者：李祥攀
通讯作者：熊可为、赵晨
通讯单位：武汉大学人民医院肿瘤科、华中师范大学数学与统计学学院
