CRISPR指数: 可有效预测低级别胶质瘤病人的预后

今天跟大家分享一篇2022年4月发表在Frontiers in Genetics (2020 IF=4.6)上的一篇文章,题目为“A novel CRISPR/Cas9 screening potential index for prognostic and immunological prediction in low-grade glioma”。


摘要:

胶质瘤是中枢神经系统疾病中死亡率最高的一种恶性肿瘤。作者基于CRISPR/Cas9文库,采用CERES算法筛选出低级别胶质瘤(LGG)的致死基因,利用ssGSEA来创建一个新的CRISPR/Cas9筛选潜力指数(CCSPI)来预测低级别胶质瘤(LGG)的临床结果和生物学特征。文章将患者分层为低和高CCSPI组。与低CCSPI个体相比,高CCSPI患者与训练和验证集的预后较差有关(P < 0.0001),且免疫分数较高。CCSPI系统具有良好的性能,1年、3年和5年的AUC分别为0.816、0.779、0.724,nomogram模型的C-指数达到0.743(95%CI=0.725-0.760)。免疫浸润细胞和免疫检查点如PD-1/PD-L1和POLD3与CCSPI呈正相关。综上所述,CCSPI对LGG有预后价值,该模型将加深我们对不同LGG亚型的中枢神经系统和免疫系统之间相互作用的认知。

DOI: 10.3389/fgene.2022.839884
第一作者:李祥攀
通讯作者:熊可为、赵晨
通讯单位:武汉大学人民医院肿瘤科、华中师范大学数学与统计学学院

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