Gene body甲基化

开花植物中可根据甲基化富集的区间将基因分为五类:

  1. UM(umethylated genes)
    在gene body上三种甲基化context都不富集
  2. gbM(gene body methylation)
    CG在转录区间上富集,在TSS和TES上缺失。gbM通常是管家基因,且与UM相比,基因更长,进化上更加保守。
  3. TSS: mCG只在TSS上富集,通常与基因表达负相关。
  4. CG/CHG gene:gene body上CHG富集,CHH缺失,CG可富集可缺失。这类基因表达量一般较低。
  5. CHH/RdDM gene:CHH富集。通常不表达。
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