ggplot2: 山脊图

绘制山脊图

https://blog.csdn.net/biocity/article/details/107570578
https://blog.csdn.net/weixin_43180762/article/details/109603279
https://zhuanlan.zhihu.com/p/371296688
https://zhuanlan.zhihu.com/p/339605450

所需要的包：ggridges

ggplot()+geom_density_ridges(data=, aes(x=, y=, fill=), alpha=, from=)

• 1.x= : 横坐标对应列名
• 2.y= : 纵坐标分割所用的量，这个量必须是因子
• 3.from=: 左侧开始的数值，如果不设置，函数会自动进行模拟填补，出现不存在的值

qq <- kk_new[,c(19,17)]
head(qq)  #'示例一

ggplot()+geom_density_ridges(data = qq, aes(x=Pseudotime, y=type, fill=type),alpha=0.8)+theme_cowplot() + scale_y_discrete(limits=as.factor(rev(c(1,2,3,6,5,0,4))))  #示例二

ggplot()+geom_density_ridges(data = qq, aes(x=Pseudotime, y=type, fill=type),alpha=0.8)+theme_ridges() + scale_y_discrete(limits=as.factor(rev(c(1,2,3,6,5,0,4))))  #使用山脊图主体，示例三

示例一

示例二

示例三