2018-11-23 群体遗传学的知识记录

什么是测序深度？

Sequence Depth

测序得到的碱基数总量（我们以bp记录的）与基因组总的大小（bp）的比值

我们还要考虑一个测序覆盖度

Sequence Coverage

覆盖度是指测序获得的序列占整个基因组的比例。由于基因组中的高GC、重复序列等复杂结构的存在，测序最终拼接组装获得的序列往往无法覆盖有所的区域，这部分没有获得的区域就称为Gap。