小编前面给大家详细介绍了
当然主要用到的是R语言来做富集分析和可视化。有小伙伴反映没有R基础,能不能做出发表级的GO和KEGG富集分析图。
没有R基础可以学习嘛
当然不愿意学,也是可以做出发表级图片的。小编前面也用了好几期的内容来给大家分享如何零代码做GO和KEGG富集分析,主要用到的是DAVID这个网页工具,并且零代码展示GO和KEGG富集分析的结果,主要用到的是Excel。
1.基因富集工具DAVID介绍(一)-基因ID转换
2.基因富集工具DAVID介绍(二)-KEGG富集分析
3.基因富集工具DAVID介绍(三)-零代码展示KEGG富集结果
4.基因富集工具DAVID介绍(四)-GO富集分析及柱形图展示
5.零代码GO富集分析—柱形图同时展示BP,MF,CC,KEGG
你看下面这篇文章,发表在scientific reports上。虽然被称为四大水刊之一,但是也毫不影响人家的影响因子上4.380。
下面就是这篇文章中的GO和KEGG富集分析图,眼尖的小伙伴应该一眼就能看出是用Excel画出来的。
上面这张figure分了四张柱形图来分别展示BP,CC,MF和KEGG,这种方法小编在下面这个视频中已经详细介绍过了
☞零代码GO富集分析—柱形图同时展示BP,MF,CC,KEGG
可能有小伙伴会说,有些文章里面用到的是下面这种展示方法,BP,CC和MF在同一张图里面展示,分别用不同的颜色来区分。其实如果仔细看过小编前几期视频内容的小伙伴,应该能自己做出这张图来。如果搞不定的,可以参考文末视频。