一、写在前面
初次接触到生信星球是在2020年初，还记得当时所拜读的文章为《TCGA（转录组）差异分析三大R包及其结果对比》，然后就持续关注了，文章写的很好，很适合生信零基础的小白学习。虽然自己有自学生信小半年，但我的生信知识体系是混乱的，还需要继续打磨。这次加入生信星球的学习小组主要是想系统学习一下生信入门，补一下生信基础。感谢生信星球的花花姐给予的学习机会以及指导。加油！坚持！
二、太长不看版
那就看思维导图吧
Day1学习笔记.png
三、markdown学习实战版
实战就分析一个GEO数据集吧
GSE27447
该数据集总共包含19例乳腺癌样品，其中14例为非三阴性乳腺癌，5例为三阴性乳腺癌。具体如下表：
| 样品名 | 类型 |
|---|---|
| GSM678364 | non-TNBC |
| GSM678365 | non-TNBC |
| GSM678366 | non-TNBC |
| GSM678367 | non-TNBC |
| GSM678368 | non-TNBC |
| GSM678370 | non-TNBC |
| GSM678371 | non-TNBC |
| GSM678372 | non-TNBC |
| GSM678374 | non-TNBC |
| GSM678376 | non-TNBC |
| GSM678377 | non-TNBC |
| GSM678379 | non-TNBC |
| GSM678380 | non-TNBC |
| GSM678381 | non-TNBC |
| GSM678369 | TNBC |
| GSM678373 | TNBC |
| GSM678375 | TNBC |
| GSM678378 | TNBC |
| GSM678382 | TNBC |
R包加载
rm(list = ls ()) #魔幻的一键清空
library (annoProbe) #生信技能树的福利R包，我最喜欢用来注释
library(GEOquery) #下载GEO表达矩阵所用的包
library(ggplot2) # 万能的可视化画图包
library(ggstatsplot)
library(reshape2)
library(patchwork)
四、写在最后
时间关系，今天学习就到尾声，明天继续加油！感谢生信星球！
