ASreml VS WOMBAT-文献解析

ASreml VS WOMBAT-文献解析

参考文献

Waheed A, Khan M S. Computing genetic parameters and breeding values in Nili-Ravi buffaloes – experiencing Wombat and ASREML software[J]. Pakistan Journal of Zoology, 2009, 9:587-592.

摘要

abstract

这篇文章的主要目的是为了比较ASreml和WOMBAT两个软件在计算遗传参数中的特点,数据采用了单性状动物模型,数据有1534个,系谱数据有1702个,固定因子为:herd, year, season,估算305-day的产奶量的遗传力。

示例数据:

前三列是系谱数据


图片.png

WOMBAT示例代码

wombat

ASreml示例代码

asreml

分析结果

result

结果可以看到,两者BLUP值估计大体一样,但是ASreml给出了BLUP的标准误,而WOMBAT没有给出。

结论

  • ASreml比WOMBAT处理数据和编写代码更简单
  • ASreml 比WOMBAT更容易收敛
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