ASreml VS WOMBAT-文献解析

参考文献

Waheed A, Khan M S. Computing genetic parameters and breeding values in Nili-Ravi buffaloes – experiencing Wombat and ASREML software[J]. Pakistan Journal of Zoology, 2009, 9:587-592.

摘要

abstract

这篇文章的主要目的是为了比较ASreml和WOMBAT两个软件在计算遗传参数中的特点，数据采用了单性状动物模型，数据有1534个，系谱数据有1702个，固定因子为：herd, year, season，估算305-day的产奶量的遗传力。

示例数据：

前三列是系谱数据

图片.png

WOMBAT示例代码

wombat

ASreml示例代码

asreml

分析结果

result

结果可以看到，两者BLUP值估计大体一样，但是ASreml给出了BLUP的标准误，而WOMBAT没有给出。

结论

• ASreml比WOMBAT处理数据和编写代码更简单
• ASreml 比WOMBAT更容易收敛