MultiQC的安装

1.在已经安装conda的条件下安装multiqc
首先要进入conda环境

multiqc需要在特定的python包下才能运行，所以创建python27环境，在这个环境下运行multiqc

conda create  --name  python27  python=2.7 -y
conda activate python27 

运行结果

2.进入环境后安装multiqc

conda  install  multiqc

运行结果

3.multiqc进行评价
先进行fastqc得到qc结果，再用multiqc进行评价

fastqc Akle_TTAGGC_L004_R1_001.fastq.gz
fastqc  Akle_TTAGGC_L004_R2_001.fastq.gz

创建一个文件夹1119，将得到的2个zip文件放进去

multiqc -n 1119 ./

结果

得到1119_data和1119.html

结果

用浏览器打开