Comparative Genomics Sheds Light on the Convergent Evolution of Miniaturized Wasps 比较基因组学揭示了小型寄生蜂的趋同进化
原文链接:https://academic.oup.com/mbe/article/38/12/5539/6369521
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Miniaturization,小型化,是昆虫适应性进化的一种策略,那为什么有的昆虫很大,有的昆虫却很小呢? 尤其在寄生蜂中,为了将卵产在其他寄主体内,促使它们进化出更小的体型。本文就是利用比较基因组的方法,从基因组层面来找出问题可能的答案。
寄生蜂进化树
在Chalcidoide(小蜂总科)和 Platygastroidea(广腹细蜂科)等在进化分支比早的类群中,有很多体型较小的寄生蜂,如赤眼蜂科等,说明在寄生蜂祖先中发生了小型化事件。
研究对象
1: Trichogramma pretiosum 短管赤眼蜂: Trichogrammatidae科 (superfamily Chalcidoidea),体型只有 0.3 mm。
2: Telenomus remus 夜蛾黑卵蜂:superfamily Platygastroidea,体型只有 0.5 mm。
蜂的体型大小对比.jpeg
研究结果
1. 染色体水平黑卵蜂基因组测序结果
基因组基本信息
染色体数量及重复序列的比例
黑卵蜂的基因组(129Mb)相比较其他的寄生蜂是相对较小的(180-340M b),可能的原因有重复序列(TEs)的数量较少且内含子较短。
2. 系统发育分析&基因含量的比较与基因家族的进化
系统发育分析
不明白为什么有D图还要加一个C图?
两种小寄生蜂的蛋白进化速率都较快,且黑卵蜂的进化速率更快一些。
**3.
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rank这里咩有看懂,需要再看看。
提出了几种证据,说明这两个寄生蜂的蛋白是快速进化的。
提出假设
这种基因家族的快速进化为了适应体型小型化和寄生行为
**4.聚合加速蛋白质可能反映了两种寄生蜂对于体型小型化的适应 **