学习小组Day7笔记-甜甜圈

1. 测序过程和原理

参考文章:测序的世界
生信基础知识复习之测序

Sanger测序

Sanger测序

二代测序

参考:【陈巍学基因】视频1
第二代测序(Next-generation sequencing,NGS):又称为高通量测序(High-throughput sequencing),是基于PCR和基因芯片发展而来的DNA测序技术。

flowcell: 测序反应的载体/容器,1个flowcell有8个lane
lane: 测序反应的平行泳道,试剂添加、洗脱等过程的发生位置
tile: 每次荧光扫描的位置,肉眼是看不到的
双端测序: 可能序列比较长有四五百bp,两边各测120-150bp
junction: 双端测序中间一些没有测到的区域
flowcell构造:一个lane包含两列(swath),每一列有60个tile,每个tile会种下不同的cluster,每个tile在一次循环中会拍照4次(每个碱基一次)

  1. DNA文库
    超声波打断DNA分子→酶补平末端→3‘端加一个A碱基→在两端加上互补配对的adapter→PCR扩增

  2. 上样

  3. 桥式PCR
    把文库种到芯片上去,然后进行扩增的过程。
    文库两端的序列和芯片上的序列是互补的,会产生互补杂交,

  4. 测序
    双端测序之Forward Strand
    Index测序


    Illumina测序流程

三代测序

参考文章:DNA测序技术的发展:第三代测序技术

2. 测序的类型

测序类型
最后编辑于
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
【社区内容提示】社区部分内容疑似由AI辅助生成,浏览时请结合常识与多方信息审慎甄别。
平台声明:文章内容(如有图片或视频亦包括在内)由作者上传并发布,文章内容仅代表作者本人观点,简书系信息发布平台,仅提供信息存储服务。

相关阅读更多精彩内容

友情链接更多精彩内容