总结卡方检验(Chi-square test)和费舍尔精确检验(Fisher exact test)

细节可参考:
https://www.plob.org/article/9194.html
https://blog.csdn.net/u011955252/article/details/50704459
https://www.cnblogs.com/emanlee/archive/2008/10/25/1319569.html
https://statsandr.com/blog/fisher-s-exact-test-in-r-independence-test-for-a-small-sample/

使用结论:
一:对于2*2的列联表:

(1)当T(此处为最小理论频数,下同)>=5, n>=40 时,直接用Pearson 卡方检验;
(2)当1 = 40 时,需要用连续性校正公式做卡方检验。这是因为卡方分布为连续型分布,而2*2列联表资料是分类资料,所以样本量较小时要进行连续性校正。
(3)当T<1 , 或者 n < 40, 或做卡方检验后所得的P值接近检验水准a 时,用Fisher exact test

二:对于行×列表资料检验
要求每个格子中的理论频数T均大于5或1<1或1

注意:

理论频数,并非实际观测值

可参考:https://www.cnblogs.com/emanlee/archive/2008/10/25/1319569.html

理论频数计算:

> b <- data.frame(CD=c(19,34), contol=c(24,10))
> b
  CD contol
1 19     24
2 34     10
> chisq.test(b)$expected
          CD  contol
[1,] 26.1954 16.8046
[2,] 26.8046 17.1954

在通过判断理论值T及总数n进行选择Chi-square test还是Fisher exact test

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