使用Aspera上传测序原始数据到NCBI

快速上传较大的文件

1. Aspera下载安装

下载地址:https://downloads.asperasoft.com/connect2/

网站的下载按钮将默认匹配检测到的计算机操作系统。

根据安装向导安装完成之后。

2. 设置坏境变量

我的电脑 → 鼠标右键 → 属性 → 高级系统设置 → 环境变量 → 新建 → 变量名:ASPERA_SCP_PASS,值:路径/aspera.openssh → 确定

3.根据提示,下载key file

保存在一个容易记住的位置。我是直接保存在原始数据的文件夹里面。

4. 命令行

Windows + R→  输入cmd → 确定 → 打开命令提示符

输入命令

# 打开对应目录下的ascp,连接key file,上传参数,数据存放的目录,邮箱

例如: “C:\Users\Song70\AppData\Local\Programs\Aspera\Aspera Connect\bin\ascp.exe" -i “I:\PacBio\aspera.openssh" -QT -l100m -k1 -d “I:\PacBio” subasp@upload.ncbi.nlm.nih.gov:uploads/自己的NCBI邮箱名称_0hotXahs

5.运行后,上传速度特别快

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