1. TPIA
全称：Tea Plant Information Archive (TPIA)
网址：http://tpia.teaplant.org or http://tpdb.shengxin.ren
首页：
网站介绍：茶是世界上最受欢迎的三种非酒精饮料之一，具有重要的经济、健康和文化价值。它含有丰富的特征性代谢物，如多酚、咖啡因、茶氨酸、维生素和对人体健康有益的矿物质。该项目致力于整合茶树的多组学数据，建立茶树的内部网络，以帮助茶树群体更好地进行遗传资源的开发。目前发布的TPIA采用了第一个全面注释的茶树基因组(Camellia sinensis)作为框架，并整合了丰富的组织良好的转录组(来自茶树和21种茶树)，不同的基因表达模式(跨物种、组织、胁迫和激素处理)，广泛的茶叶品质相关代谢物，大量人工筛选的功能基因，以及从全球收集的中国等主要茶叶生产国的种质资源信息。
文章引用：Xia, En-Hua et al. “Tea Plant Information Archive: a comprehensive genomics and bioinformatics platform for tea plant.” Plant biotechnology journal vol. 17,10 (2019): 1938-1953. doi:10.1111/pbi.13111
2.TeaPGDB
全称：Tea Plant Genome Database （TeaPGDB）
网址：http://eplant.njau.edu.cn/tea
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网站介绍：茶树是一种常绿灌木或小乔木，其叶子和叶芽被用来生产茶叶。属山茶(中国:茶花;中文拼音:Cháhuā，字面意思:“茶花”)的茶科开花植物。常见的名字包括“茶树”、“茶灌木”和“茶树”(不要与茶树油的来源千层叶和新西兰的scoparium细花茶树混淆)。随着基因组学时代的到来，茶树基因组测序工作得到了极大的推动，并产生了大量的数据。到目前发布为止，茶树基因组数据库中已有6种基因组和7组数据、基因编码序列、蛋白质序列、各种注释信息、表达数据和miRNA数据，并配置了BLAST、JBrowse分析工具。未来，我们希望茶树数据库能够成为整合茶树基因组数据和注释信息的网站，为茶树分子研究提供数据支持和相关数据分析。
文章引用：
Lei X, Wang Y, Zhou Y, Chen Y, Chen H, et al. 2021. TeaPGDB: Tea Plant Genome Database. Beverage Plant Research 1: 5 doi: 10.48130/BPR-2021-0005
3.TeaAS
全称：Database for Alternative Splicing in tea plants（TeaAS）
网址：http://www.teaas.cn/index.php
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网站介绍：茶是世界上最受欢迎的三种非酒精饮料之一，具有重要的经济、健康和文化价值。随着茶树参考基因组和转录组测序的公布，对功能基因的理解取得了很大的进展，但对选择性剪接(Alternative splicing, AS)的功能知之甚少。AS可以通过不同的剪接位点从单个mRNA前体生成多个mRNA剪接异构体，从而增强转录本和蛋白质的多样性。在茶树中，不同组织的AS分析表明，它可以调控黄酮类化合物途径。同时，AS可调节糖代谢途径和抗氧化酶对冷胁迫的响应。TeaAS的目的是提供一个全面的关于茶树AS的信息。该数据库整合了66个转录组数据中的基因组注释、AS类型、不同转录本序列、异构体表达水平和功能等信息。
文章引用：
Mi, X., Yue, Y., Tang, M. et al. TeaAS: a comprehensive database for alternative splicing in tea plants (Camellia sinensis). BMC Plant Biol 21, 280 (2021). https://doi.org/10.1186/s12870-021-03065-8
4.TeaGVD
全称：Tea plant Genomic Variations Database（TeaGVD）
网址：http://www.teaplant.top/teagvd
首页：
网站介绍：TeaGVD为各种数据类型和应用程序构建并组织为四个模块，包括基因型、表现型、工具和帮助模块。这些模块提供了用户友好的web界面，以检索和可视化基因组变异及其相关信息(基因注释、不同组织的基因表达、GWAS结果等)。
20211231初次整理，将持续更新。。。
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