学习R包:
1、设置镜像:
*options函数就是设置R运行过程中的一些选项设置
options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) #对应清华源
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/") #对应中科大源
*图源生信星球
2、安装加载:
R包安装命令是install.packages(“包”)或者BiocManager::install(“包”)。取决于你要安装的包存在于CRAN网站还是Biocductor。
3、dplyr五个基础函数:
①mature()—新增列
②select()—按列筛选
例:按列号筛选:
按列名筛选:
③fitter()—筛选行
例:
④arrange()—按某1列或者某几列对整个表格进行排序
⑤summarise()—汇总
例:
4、dplyr两个实用技能:
①管道操作 %>% (cmd/ctr + shift + M)
②count统计某列的unique值
5、dplyr处理关系数据:
即将2个表进行连接,注意:不要引入factor
①內连inner_join,取交集
②.左连left_join
③全连full_join
④半连接:返回能够与y表匹配的x表所有记录semi_join
⑤.反连接:返回无法与y表匹配的x表的所记录anti_join
⑥简单合并
在相当于base包里的cbind()函数和rbind()函数;注意,bind_rows()函数需要两个表格列数相同,而bind_cols()函数则需要两个数据框有相同的行数