package or namespace load failed for ‘gert’ in dyn.load，unable to load shared object——2024-09-06

一、网上建议，安装libgit2

root安装：

yum install libgit2-devel

非root安装（devtools安装出错 gert包按不上 - 组学大讲堂问答社区 (omicsclass.com)）：

conda install conda-forge::libgit2
R CMD INSTALL gert_2.1.1.tar.gz # 这个用系统R可以安装，但是用自己用conda安装的R就不行

但是，安装libgit2成功后依然不能安装gert包

二、conda安装，成功

conda activate R4.3 # 进入R4.3环境，R4.4.1的bug太多了
conda install -c conda-forge libgit2
conda install -c conda-forge r-gert

> library("gert")
# Linking to libgit2 v1.7.1, ssh support: NO
# Global config: /public/home/xuanjj/.gitconfig
# No default user configured
# Warning message:
# package ‘gert’ was built under R version 4.3.2