R程序包是多个函数 的合集，具有详细的说明和示例。
特定的分析功能，需要用相应的程序包实现。
一、R包来源
1.CRAN网站：install.packages()
2. Biocondutor : BiocManager::install()
3.github(是正在开发版本的包)：devtools::install_github()
image.png
二、R包-代码没错，哪里错了
1.大片提示信息：检查是否有error，没有就忽略；
2.package not available
a.包名写错
b.安装命令使用错误
c.本机的R语言版本与包所要求的版本不符合
d.包过时被剔除了
3.是否更新：能不更新就不更新，除非一直报错。输入n，回车，
4.加载A包，报错B包不存在:那就先安装B（通常这种是依赖包），在安装和加载过程中的报错信息，注意看引号，引号里大多是依赖包的名字。
5.报错中有connection或url，404，http。网络限制了
三、R包如何使用-获取帮助
1.快速查看函数帮助文档 ？sd
2.找R包介绍页面（例如 limma package）
3.Vignettes :browseVigmettes("stringer")
四、认清函数和数据
image.png
