思路清奇SCI20.EMT+胶质瘤.6.6分

预后模型在肿瘤中地位非凡,今天在看文献中发现一篇挺独特的文献。下面就来欣赏下:


作者考虑到EMT(上皮间质转分化)在胶质瘤中作用比较大,再结合EMT在肿瘤干细胞(CSCs)进程中的作用,构建EMT联合CSC判断肿瘤预后的模型。

结果解读

1.根据EMT及CSC基因进行聚类


聚类后结果表明,单独根据EMT及CSC并不能完全将肿瘤区分开。

2.每个marker组的预后判断能力

3.marker组间的相互作用关系(类似PPI网络图)

4.marker组间的相关性

5.随机组合预后判断(森林树构建预后模型)

6.确定最终模型


参考链接:
1.Promising Prognosis Marker Candidates on the Status of Epithelial-Mesenchymal Transition and Glioma Stem Cells in Glioblastoma
2.胶质母细胞瘤中上皮-间充质转化和胶质瘤干细胞状态的有前景的预后标志物候选

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