Cytoscape 3.10版软件安装插件的三个办法:
使用老版本。Cytoscape 3.9版本或更低,软件自带安装商店可以正常使用,网上教程很多使用的这种办法。
其它来源获得插件,本地进行安装。需要自己找插件,这种方式也有很多教程。
此外,还可以使用R语言RCy3包通过installApp() 函数来安装。
# 打开Cytoscape软件
# 测试连接情况
cytoscapePing ()
# 软件版本
cytoscapeVersionInfo ()
# 安装ClueGO插件
installApp('ClueGO') # 安装完成后R中会显示:App ClueGO installed
installApp('CytoNCA')