写在前面
今天,课题组的第一篇综述见刊了。需要重点感谢
国家“青年千人”启动基金的支持和广东省教育厅的创新团队项目的支持,课题组成员,HR编辑以及匿名审稿人在文章整理过程中提出的宝贵建议
高大上又接地气的 Horticultue Research微信公众号,已经推了一文,即《华南农大青年千人夏瑞课题组 概述了园艺作物小分子RNA研究现状》。该微信推文中,已经列出了文章中大家都比较满意的图片。这里就不加以赘述。感兴趣的朋友,可关注《园艺研究》微信公众号,或者直接跳转查看对应推文
当然,也可以查看文章全文
写这个推文,一方面,是这篇综述上,课题组和HR编辑以及审稿人都投入了时间和经历,那么应该增加一点曝光度;另一方面,是文稿中,有一张图,其实也是TBtools输出的图片,再进行细调。即,以下
这个图片应该是TBtools相对早期版本输出的结构域信息图片了,目前看来不是太满意。不过这个图片的存在,说明了一个问题,即TBtools里面的每一个工具,可能都是课题组的一个课题需要。
进入主题
上图如何绘制,可以直接参考《历史消息》。此处简单说明如下:
- 下载已报到的番茄ARF基因家族成员蛋白序列
- 将序列提交到NCBI的Batch CDD Search,并得到相应图片
- ARF上存在的小RNA靶位点(包括miRNA和phasiRNA[tasiRNA]的靶位点)
- 进行坐标转换(因为domain是蛋白坐标,target site是mRNA坐标)
- 将以上数据输入TBtools,即可得到图片(包括target site)
- 打开AI或者CDR,使用剪刀形状替换domain site(类似的形状修改功能,之前已经更新,接下来我们组的某个工作中,大家应该会看到)
基于以上操作,就可以得到封面图片。这个图片的具体含义,感兴趣的,还是看《园艺研究》公众号的推文,或是文章正文。
一直在开发,也一直有朋友可能对我在做的事情有误解。这里误解的出发点,其实是关心,或者担心。因为提醒我的朋友里面,基本都是相对亲近的人,毕竟不亲近的人并不Care。他们担心的是,我总是将精力投入到TBtools或者代码里面,或者是不务正业,或者是对以后发展没有太大帮助。
其实两者都有一点,尤其后者。但其实,也都不全是。因为,确实我在工具开发上投入的时间比例不会太小。但是,几乎每一个工具的出现,都是对应了一个课题组课题的需求。
当然,一个人最可悲的是,所有人都说你做得好,做得优秀,而没有人告诉你,你哪里错了,哪里做得不好。所以,每当有人提醒我的时候,我会有一瞬间的不乐意,但更多的是感激。
写在最后
写到此处,又用去午休的三十多分钟啦。整体推文的思路有点跳跃,这可能山竹台风的影响。。T_T。。。
总的来说,全文就想说一个事情(此处借师兄的一句话):
科研若要酷,就用TBtools。