有生信分析需求或是想学生信的朋友都知道，我们开展工作的前提是拥有一台Linux主机。这是由于这个专业的特殊性，我们使用的软件五花八门，但大多都是基于Linux平台的，且没有图形界面的命令行工具，在Windows上很难玩的转。
搁以前呢，解决办法不外乎是把Windows铲了装Linux、装双系统、装虚拟机，或是花费不菲的价格买台云主机（土豪请绕道），反正就是各种折腾，尤其对于Windows培养起来的电脑用户来说，非常的不友好，一个小小的系统问题却成了大家进阶生信大神路上的第一个绊脚石。
但是自从微软开始拥抱开源社区，情况就变得不一样了，微软和开源社区相爱相杀的精彩故事暂且不表，他的这一举动倒着实为广大人民群众带来了不小的便利。
微软宣布"Microsoft loves Linux"，于是就有了WSL，今天我们就是基于WSL搭建分析环境。
什么是WSL
WSL 全称为 Windows Subsystem for Linux，是一个为在 Windows 10 上能够原生运行 Linux 二进制可执行文件（ELF格式）的兼容层。微软早在 16 年就推出了 WSL，前一阵更是发布了 WSL 2.0，现在想必已经相对完善了。
安装WSL
安装子系统要求 Windows 10 Fall Creators Update 及之后版本，从这个版本开始，子系统才正式对外发布，之前的版本需要打开开发者选项。我们可以在设置中选择系统—-关于-—Windows 规格，来查看 Windows 版本号，大于 16215 就可以了（这年月的win10基本都满足条件了，毕竟win10是自动更新的）：
安装也是非常简单，首先以管理员身份运行Power Shell并运行：
Enable-WindowsOptionalFeature -Online -FeatureName Microsoft-Windows-Subsystem-Linux
之后，在 Microsoft Store 搜索 Linux，安装想要的 Linux 发行版。建议选择Ubuntu 18.04 LTS，因为Ubuntu是最流行且易入门的Linux发行版，具有活跃的社区，遇到问题很容易搜索到解决方案，且具有强大的软件包管理工具。
安装好之后，开始菜单中就会出现Ubuntu的图标，点击启动。
环境配置
第一次启动会花费几分钟来初始化，并需要设置用户名和密码。
查看系统版本
输入命令cat /etc/os-release
查看CPU信息
输入命令cat /proc/cpuinfo | grep processor
没错了，我的CPU是4核的
查看硬盘信息
输入命令df -h
注意看最后两行，Windows的C盘和D盘被直接挂载到Ubuntu上了。
WSL 还是挺强大的，看起来几乎和原生的Linux系统一样。我们再装些软件试试。
安装Miniconda
wget -c https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh &&
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
source .bashrc
安装成功！
安装bwa
首先创建一个虚拟环境，专门用来安装生信软件。
conda create -n bio python=3.7
创建完成后，使用conda activate bio激活环境。
输入conda install -c bioconda bwa安装bwa
没有问题，看来用WSL做生信分析是完全可行的。并且安装配置的过程简单方便，对于新手上路或者做一些不太消耗计算资源的分析是非常有帮助的。
ENJOY!
