总结昨天胶回收失败的一天,想好点样的顺序,开始实验之前一定要仔细研究胶回收试剂盒说明书,准备好试验过程中要用到的东西,做到心中有数。停止怀疑自己是实验成功的关键。
Steps:
⒈按单酶切体系点样(用PCR管),用枪吸打混匀,短暂离心将反应液收集至管底,于37℃水浴2h;
⒉用高保真酶扩增目的基因的上臂UP,点好样,用枪吸打混匀,短暂离心数秒,跑PCR;
⒊制胶:
80mL1%琼脂糖凝胶电泳(0.8g Agarose+80mLTAE电泳缓冲液→Goldview Ⅱ型核酸染料)-- 用1.5mm和2mm梳子;
⒋点样:
6×DNA Loading Buffer,20μL体系6×DNA Loading Buffer加4μL;
⒌Trans2K® DNA Marker和 5kMarker点5μL
⒍记好自己的点样顺序
⒎凝胶成像系统拍照(Image Lab Software)
点击打开Image Lab → 点击新建实验协议 → 点击选择凝胶类型(核酸凝胶-Ethidium Bromide)→ 点击放置凝胶 → 打开凝胶放置槽放入凝胶 → 点击运行实验协议 → 滤光片位置选择自动默认 → 确认后开始检测,弹出图片 → 在分析工具箱选择需要调整的项目 → 在文件栏目下选择导出--导出以便发布 → 点击导出(600dpi) → 选择保存类型JPJ →保存后关闭软件及凝胶成像仪
⒏切胶--切胶器(TRANS UV)
利用全式金胶回收试剂盒(EasyPure Quick Gel Extraction Kit)(离心柱吸附)
原理:
利用异硫氰酸胍法溶胶,利用硅胶膜离心柱特异地吸附DNA,适用于从TAE或TBE琼脂糖凝胶中回收DNA片段,操作简单快速。纯化得到的DNA可用于酶切、连接、克隆、测序等多种操作。
Prepare:
使用前加不同体积无水乙醇到WB中;
开始试验前打开55℃水浴锅,ddH2O于65℃水浴锅预热;
加异丙醇(为增加DNA回收量,按1:1比例,即凝胶重为100mg,加入100μL异丙醇)
所有离心均在室温下进行。
操作步骤:
切胶(用切胶器,速度要快)→ 称重 → 加3倍体积的GSB溶液→ 于55℃水浴溶胶10min → 枪转移至离心柱中静置1min →10,000×g离心1min,弃流出液 → 加650μL溶液WB,10,000 ×g离心1min,弃流出液 → 空甩1-2min,去除残留的WB → 将离心柱置于一干净的离心管中,开盖静置1min → 在柱的中央加入40μL预热的ddH2O → 室温静置1min → 10,000×g离心1min洗脱DNA两次 → 将洗脱出的DNA于-20℃保存 → 吸取5μL测浓度
注意事项:
⑴ 为了保证回收效果,电泳时使用新鲜电泳缓冲液。
⑵ 切胶时,胶块尽量小;溶胶时,确保胶块完全融化。
⑶ 为避免紫外照射对DNA造成损伤,影响下游的实验(如克隆,连接),紫外照射时间尽量短。
Mini point:超微量分光光度计(dsDNA浓度测定)
1μLddH2O Blank校正
DNA纯度:OD260/OD280=1.8-2.0